Energomontaż-Południe SA stosuje zasady ładu korporacyjnego określone w dokumencie Dobre Praktyki Spółek Notowanych na GPW, stanowiącym Załącznik do Uchwały Nr 12/1249/2010 Rady Giełdy Papierów Wartościowych w Warszawie SA z dnia 19 maja 2010 r.
Organami Spółki są Walne Zgromadzenie, Rada Nadzorcza oraz Zarząd.
Najwyższym organem Spółki jest Walne Zgromadzenie. Walne Zgromadzenie jest zwoływane w terminie sześciu miesięcy po upływie każdego roku obrotowego.
Rada Nadzorcza sprawuje stały nadzór nad działalnością Spółki we wszystkich dziedzinach jej działalności. W ramach Rady Nadzorczej Spółki funkcjonuje komitet audytu, w skład którego wchodzą członkowie niezależni od Spółki i podmiotów pozostających w istotnym powiązaniu ze Spółką. Wśród tych osób znajdują się członkowie posiadający stosowne kompetencje w dziedzinie rachunkowości i finansów. Wszyskie osoby nadzorujące Spółkę złożyły oświadczenia, z których wynika iż trzy osoby nadzorujące posiadają przymiot faktycznej niezależności od akcjonariuszy mających prawo do wykonywania nie mniej niż 5% ogólnej liczby głosów na walnym zgromadzeniu. Pozostałe dwie osoby nadzorujące są powiązane z akcjonariuszem PBG S.A. Spółkę PBG S.A. reprezentują w Radzie Nadzorczej Energomontaż-Południe S.A. Pan Andrzej Wilczyński oraz Pan Tomasz Woroch. Oświadczenia osób nadzorujących dotyczące powiązań z akcjonariuszami firmy są dostępne w siedzibie Spółki.
Zarząd stanowi organ wykonawczy Spółki oraz reprezentuje ją na zewnątrz. Kierując się interesem Spółki określa strategię oraz główne cele działania Spółki, po czym jest odpowiedzialny za ich wdrożenie i realizację. Zarząd dba również o przejrzystość i efektywność systemu zarządzania Spółką oraz prowadzenie jej spraw zgodne z przepisami prawa i dobrą praktyką.